1900-1972 гг.А.Н. Пробатов принадлежит к славной плеяде ученых-ихтиологов, способствовавших развитию рыбохозяйственной науки в советский период.
В 1926-1929 гг. он – сотрудник отдела прикладной ихтиологии Государственного института опытной агрономии (г. Ленинград), который возглавлял позднее академик Л.С. Берг. В этот период участвовал в исследованиях на Псковском, Чудском, Ладожском озерах, реке Свири и на Аральском море. В 1929-1932 гг. работал в качестве старшего научного сотрудника в Тихоокеанском научном институте рыбного хозяйства (ТИРХ, позднее – ТИНРО, г. Владивосток), проводя исследования на реке Амуре, в Охотском и Беринговом морях. В 1932-1934 гг. был сотрудником СевПИНРО (г. Архангельск), занимаясь изучением ихтиофауны Белого и Карского морей.
В 1934 г. по рекомендации Л.С. Берга и А.С. Зернова был приглашен на заведование кафедрой зоологии позвоночных в Пермский университет. Ранее он преподавал в Дальневосточном рыбвтузе. В 1937 г. становится заведующим кафедрой зоологии Краснодарского пединститута. Одновременно он занимается научно-исследовательской работой по изучению ихтиофауны северо-восточной части Черного моря и рек Кавказского побережья.
С 1943 по 1947 г. А.Н. Пробатов возглавлял Карскую экспедицию, где не только собрал уникальные материалы по юго-восточной части моря, послужившие основой его докторской диссертации, но и организовал в Карской губе промысловую факторию по добыче рыбы, морского зверя и пушнины в прилегающем участке Большеземельской тундры.
В 1947 г. А.Н. Пробатов был переведен на Южный Сахалин в СахТИНРО, где лично вел исследования сельди. В 1953-1957 гг. заведовал кафедрой зоологии позвоночных Ростовского государственного университета. В этот период проводил научно-исследовательскую работу в северо-восточной части Черного моря и на Азовском море.
В августе 1957 г. перешел на работу в г. Калининград на должность заместителя директора БалтНИРО (позднее АтлантНИРО) по научной части, а в 1959 г. был переведен в Калининградский рыбвтуз, где вначале заведовал кафедрой зоологии и физиологии животных, а с 1962 г. – кафедрой ихтиологии и сырьевой базы.
В 1958 г. А.Н. Пробатов проводил ихтиологические исследования у западного побережья Африки на БМРТ «Казань». В 1960 г. вел исследования в бассейне Индийского океана у Малакки и Индокитая по оценке состояния сырьевой рыбной базы и возможности развития рыболовства в этом регионе. В 1962 г. участвовал в научно-промысловой экспедиции к побережью Испанской Сахары.
Основными результатами проведенных исследований на всех водоемах были рекомендации по организации промысла и рациональному использованию рыбных ресурсов, совершенствование методов рыбохозяйственных исследований, что нашло отражение в 108 опубликованных работах.
А.Н. Пробатов причислял себя к ихтиологам прикладного профиля школы академика Н.М. Книповича. Большинство его работ связано с решением прикладных вопросов и способствовало решению основных задач, стоявших перед рыбной промышленностью страны.
