Работа научных наблюдателей на российских рыбодобывающих судах является одним из показателей расширения российских научных исследований в Мировом океане и имеет особую важность для 
оценки современного состояния эксплуатируемых биоресурсов. Научные наблюдатели АтлантНИРО на борту российских рыбодобывающих судов выполняют научно-исследовательские программы АтлантНИРО и международных региональных организаций и комиссий по рыболовству в Атлантическом океане, юго-восточной части Тихого океана и Конвенционной зоне АНТКОМ. Основная цель их 
работы – это сбор промыслово-биологической информации по основным промысловым видам рыб и прилову, в том числе согласно требованиям региональных международных организаций и комиссий, таких как НАФО, СПРФМО, АНТКОМ.
В последние годы наблюдатели традиционно работают в океанических районах сферы деятельности института (Западно-Европейская котловина и подводная возвышенность Роколл, Центрально-Восточная Атлантика – зоны Марокко и Мавритании, юго-восточная часть Тихого океана, район Антарктиды). В последние несколько месяцев деятельность научных наблюдателей АтлантНИРО в океанических районах временно приостановилась из-за ограничений, связанных с пандемией коронавирусной инфекции. В настоящее время по причине снятия ограничений по COVID-19 организация работы в 
данном направлении возобновляется.
16 июня 2020 г. научный наблюдатель АтлантНИРО направляется из г. Калининграда в г. Мурманск с последующим вылетом с экипажем судна РТМКСм «Адмирал Шабалин» в г. Нуадибу (Мавритания). По предварительной информации судовладельца судно будет около одного месяца вести промысел в ИЭЗ Мавритании. Затем РТМКСм «Адмирал Шабалин» перейдет в район южной части Тихого океана, где будет вести промысел ставриды в районе регулирования Региональной организации по управлению рыболовством в южной части
Тихого океана (СПРФМО). Научный наблюдатель будет выполнять сбор промыслово-биологической информации и работать в рамках программы СПРФМО.
В середине июля 2020 г. планируется направить двух научных наблюдателей в район моря Ирмингера на промысел окуня-клювача для сбора промыслово-биологической информации и работы в рамках Организации по рыболовству в северо-западной части Атлантического океана (НАФО).
В середине августа 2020 г. планируется направить группу научных наблюдателей в район Центрально-Восточной Атлантики с целью сбора промыслово-биологической информации. В период рейса будет выполняться сбор данных по величине уловов, видовому составу, размерно-весовой структуре, биологическим характеристикам и среде обитания облавливаемых биоресурсов в целях получения научных материалов для прогноза объемов возможного (рекомендованного) вылова водных биологических ресурсов на 2022 г., разработки научно обоснованных рекомендаций по регулированию и развитию российского рыболовства, осуществляемого в океанических районах, а также защиты интересов российского рыболовства в рамках сотрудничества России с прибрежными западноафриканскими странами в области морского рыболовства.
